تکنیک های آزمایشگاهی

ناخالصی خوب نیست

موضوعی گسترده اما فرایندی ظریف

 پروتئین­های نوترکیب در سراسر علم بیولوژی و زیست ­

پزشکی استفاده می­شوند.

به ­وجود آمدن سیستم­های جدید، تولید پروتئین­های 

نوترکیب را گسترده ­تر کرده است.

از همه مهم­تر،این پروتئین­ها به طورچشم­گیری تعداد پروتئین­هایی

را که می­توان از نظر ساختاری

مورد بررسی قرار داد، افزایش داده­ اند.

از آنجا که هر پروتئین متفاوت است، پروتکل­ها و استراتژی­های

خالص ­سازی، باید برای هر پروتئین جداگانه و با توجه

­­به استفاده مورد نظر آن تهیه شود.

اما به­ طورکلی، چگونه می­ توان پروتئین­های نوترکیب

را بیان و تخلیص کرد؟

پروتئین­های نوترکیب چیستند؟

 پروتئین­های نوترکیب با انتقال ژن­های خارجی به سلول

میزبان تشکیل می­شوند.

پروتئین­های نوترکیب معمولاً برای تولیدمحصولات دارویی،

پلیمرهای مبتنی بر پروتئین، آنتی­ بادی­ها و آنزیم­ها برای درمان

بیماری، داربست ­های پروتئینی برای مهندسی بافت و همچنین

برای موارد بی­ شمار دیگر استفاده می­شوند.

 

مراحل تولید پروتئین نوترکیب چیست؟

 ابتدا، mRNA ژن مورد نظر به cDNA تبدیل می­شود تا DNA

رمزگذار را ارائه دهد.

cDNAبین یک پروموتر (اغازگر رونویسی) باکتری و یک

خاتمه ­دهنده باکتری شبیه ­سازی می­شود، بنابراین

دستگاه رونویسی و ترجمه باکتری دنباله کدگذاری را بیان

می­کند.

در تولید پروتئین نوترکیب، ژن پروتئین مورد نظر در یک ناقل،

کلون شده و در یک موجود زنده نمونه، بیان می­شود.

 

IMG 20211015 142925 719

تولید پروتئین نوترکیب

بيان پروتئین نوترکیب چیست؟

 بیان پروتئین، به فرایندهایی اطلاق می­شود که نحوه ­ی

سنتز، اصلاح و تنظیم پروتئین­ها را توسط سلول­ها یا موجودات

زنده نشان می­دهند. در بياني ديگر، شامل ایجاد یک کپی

RNA از کد DNA است.

به ­طورخلاصه، فرایند بیان پروتئین شامل بیان ژن

و مراحل سنتز پروتئین است.

بیان پروتئین نوترکیب به ساخت

پروتئین­های مشتق شده از DNA نوترکیب اشاره دارد.

این روش، درحال­ حاضر، به ­طور معمول در زیست ­شناسی

­مولکولی و در تولید داروهای مبتنی بر پروتئین و پپتید

استفاده می­شود.

بسیاری از پروتئین­هایی که در گذشته از منابع حیوانی

گرفته شده­ بودند، اکنون می­توانند با بیان پروتئین نوترکیب

و سپس برداشت و تصفیه آنها از سلول­های میزبان سنتز شوند.

با این حال، قبل از شروع بیان پروتئین در مقیاس بزرگ،

معمولاً بیان پروتئین در مقیاس کوچک انجام می­شود.

بسیاری از سلول­های E. coli از نظر شیمیایی مناسب

برای تبدیل و بیان پروتئین، درحال حاضر، به عنوان کیت

تحقیقاتی در دسترس هستند.

سایر سیستم­های بیان پروتئینی که معمولاً مورد استفاده

قرار می­گیرند شامل سیستم­های سلولی مشتق ­شده از

مخمر، باکولوویروس یا حشرات و سلول­های پستانداران،

و در سال­های اخیر، قارچ­های رشته­ای هستند.

 

فرآیند بیان پروتئین نوترکیب در یک

سیستم، به اطلاعات زیر نیاز دارد:

انتخاب بردار بیان مناسب برای درج توالی ژن

انتخاب سیستم مناسب که بتواند بردار را بیان کند

روش­های مناسب غربال­گری و افزایش مقیاس

 

بردار بیان پروتئین نوترکیب چیست؟

 بردارهای بیان، اغلب برای افزایش بیان ژن استفاده میشوند.

این بردارها یک پروموتر (اغازگر رونویسی یک ژن) قوی برای

بیان ژن کلون شده را فراهم می­کنند.

بردارهای بیان، همچنین حاوی ژن­های مقاوم به آنتی­ بیوتیک

هستند که امکان انتخاب ناقل و پروتئین نوترکیب را فراهم

می­کند.

بردارهای بیان برای ساخت پروتئین­های یوکاریوتی در باکتری­ها

استفاده می­شوند.

این ناقل دارای محل اتصال ریبوزوم، توالی پایانی و یک

پروموتر قوی تنظیم­ شده­ است.

 

تخلیص پروتئین­های نوترکیب
چیست؟

پروتئین­های نوترکیب، در سلول­های میزبان به همراه تنوع زیادی

از مولکول­ها که به­ طور طبیعی در آنها وجود دارد، تولید می­شوند.

با این حال، در بیشتر کاربردهای آنها (برای مثال در درمان)

یک پروتئین نوترکیب باید خالص شده و از بقیه، جدا شود.

در مطالعه ساختار پروتئین یا توالی­ ها، تخلیص پروتئین ضروری

است.

دراین مورد، نمی­توان پروتئین مورد نظر را با سایر مولکول­ها

مخلوط کنیم تا اطمینان حاصل شود که نتایج به­ دست آمده

قابل اعتماد هستند.

مثال دیگر یک پروتئین با کاربرد درمانی است؛ موردی که در آن

ما باید اطمینان حاصل کنیم که فقط پروتئین درمانی در

ارگانیسم گیرنده تزریق می­شود تا از نتایج غیرمنتظره،

جلوگیری شود.

 

روش­های تخلیص پروتئین نوترکیب

  بیشتر روش­های تخلیص پروتئین­های نوترکیب، بر اساس

کروماتوگرافی است که در واقع مجموعه­ای از تکنیک­های

مختلف است.

تکنیک­های کروماتوگرافی بر­اساس تفاوت بین خواص پروتئین

مورد نظر و خواص بقیه مولکول­های نمونه، جداسازی را

انجام می­دهند.

این ویژگی­ها میوانند ساختارهای خاص مولکول، بار الکتریکی

یا اندازه و سایر موارد باشند.

پرکاربردترین روش برای تصفیه پروتئین، کروماتوگرافی تمایلی

است. این یکی از موثرترین تکنیک­ها است، زیرا از ترکیب

ساختار دلخواه (به نام برچسب) بر روی پروتئین استفاده می­کند.

چنین برچسبی در هیچ مولکول دیگری از نمونه وجود ندارد

و به پروتئین مورد نظر ما ویژگی­های خاصی را می­دهد که برای

تمایز و جداسازی از بقیه، مورد استفاده قرار می­گیرد.

 

 

IMG 20211015 142928 384

کروماتوگرافی تمایلی

 

با این حال، در شرایط خاص، ما نمی ­توانیم یک برچسب

به مولکول خود اضافه کنیم و باید به روش­های کمتر

اختصاصی روی­ آوریم. یکی از این روش­ها، فیلتراسیون ژل

است که مولکول­ها را با توجه به اندازه آنها جدا می­کند.

با استفاده از رزین، می­توان مولکول­ها را با مشکلاتی که

هنگام عبور از منافذ روبه­رو می­شوند، جدا کرد.

یکی دیگر از روش­های رایج، کروماتوگرافی تبادل یونی

است که مولکول­ها را بر اساس بار الکتریکی، جدا می­کند.

دو روش رایج دیگر آنهایی هستند که پروتئین­ها را بر اساس

قطبیت جدا می­کنند.

کروماتوگرافی متقابل آب­گریز وکروماتوگرافی فاز معکوس

بیشترین استفاده را دارند.

 

نتیجه ­گیری

پروتئین­های نوترکیب، در علم امروز دارای جایگاه بسیار

مهمی هستند.

در نتیجه تولید آنها نیز باید با دقت کافی انجام شود تا این

جایگاه توسط یک فرایند اشتباه، به خطر نیفتد.

همچنین خالص­سازی آنها، برای درمان بیماری­ها و موارد پزشکی

کاربرد دارد و واضح است که بیان و تخلیص پروتئین­های نوترکیب

دقت بسیاربالایی را طلب می­کند.

 

گردآورنده: صبا معجزاتی

 

منابع

xpression-systems

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

دکمه بازگشت به بالا