فهرست مطالب
سپر دفاعی از جنس دشمن
آیا میکروب هایی که خود باعث انواع بیماری می شوند، از ما در برابر دیگر ارگانیسم های مضر حفاظت می کنند؟
پوست سالم ما دارای یک سری باکتری هایی به نام “میکروبیوم” است که از
ما در برابر سایر میکروب ها محافظت میکنند؛ حتی مشخص شده است که
بسیاری از بیماری های پوستی مانند درماتیت آتوپیک و آکنه به دلیل از بین
رفتن این لایه حفاظتی باکتریایی پوست بوجود می آیند.
اما سوالی که مطرح می شود این است که نقش اصلی این میکروب ها در چنین بیماری هایی چیست؟ ویا حتی می توان این میکروبیوم ها را به روشی درست تلخیص کرد؟
با ما همراه باشید.
قبلا تصورمی شد رمزگشایی این مجموعه پیچیده از میکروارگانیسم ها
کاری بس دشوار است ولی دکتر Martin Koberle سرپرست آزمایشگاه
عفونت های پوستی دانشگاه تکنیکال مونیخ(TUM)، بدنبال شناسایی این
میکروبیوم ها برای ایجاد درمان های پوستی جدید است. در گذشته تلاش
های متخصصان پوست برای بررسی ترکیب دقیق میکروبیوم ها به بن بست
رسیده بود زیرا بر روی پلیت های حاوی محیط کشت آگار همه باکتری ها به
خوبی رشد و تکثیر پیدا نمیکردند و درنتیجه برخی از گونه های دارای رشد
آهسته را به طور کل نادیده می گرفتند.
دکتر Koberle و زیست شناس دکتر Yacine Amar که هردو بخشی از
تیم تحقیقاتی پروفسور Biederman در کلینیک پلی تکنیک تخصصی
بیماری شناسی و آلرژی در TUM هستند، با همکاری یک سازمان بین المللی
روشی را برای حذف گونه های غیرهدف DNA پیشنهاد دادند.
تیم بین رشته ای آن ها از ویژگی خاص آنزیم بنزوناز استفاده کرد. این
آنزیم، زنجیره پلی نوکلئوتیدی که اطلاعات ارثی را در همه موجودات زنده
حمل می کند به قطعات کوتاه تری تجذیه می کند و تنها DNA باکتری هایی
از این آنزیم درامان اند که دارای دیواره خارج سلولی باشند.
بنزونازها مدتی است که برای تخلیص پروتئین ها استفاده می شوند بدین
صورت که آنزیم تمام قطعات DNA و RNA خارجی را تجزیه میکند، سپس
با سانترفیوژ این RNA و DNA را از پروتئین جدامی کنند. البته از معایب
این روش آنالیز ژنتیکی جدید میتوان به این مورد اشاره کرد که مقادیر
زیادی توالی DNA از سلول های پوست و قطعات باکتری های مرده گرفته
می شود که این مقدار اطلاعات، ارزش نتیجه را کاهش می دهد.
محققان برای تعیین عملکرد میکروب ها در این مسیر از چه روش هایی استفاده می کنند ؟
برای مشخص کردن عملکرد باکتری های پوستی نیز از همین روش استفاده
می کنند؛ مواد ژنتیکی از سلول های پوست یا باکتری های مرده سطح
پوست توسط آنزیم بنزوناز تجزیه می شود و مواد تجزیه شده را از نمونه
جدا می کنند؛ سپس DNA باکتری¬های باقی مانده را بصورت مکانیکی
خارج کرده و مورد مطالعه قرار می دهند.
دکتر Yacine Amar سرپرست پروژه می
گوید:«آزمایشات ما نشان داد که با این روش
می¬توانیم DNA غیرهدف را بطور کامل
ازبین ببریم و میکروبیوم پوست را به صورت
انتخابی جداکنیم.»
منبع : دکتر Yacine Amar
او در آزمایشگاه؛ ابتدا بصورت مصنوعی نمونه¬هایی حاوی مخلوطی از
سلول¬های انسان و باکتری¬های مرده و زنده را با استفاده از یک پروتکل
دقیق ایجاد کرد سپس با بنزوناز تخلیص و مورد مطالعه قرارداد.
این محقق می¬گوید:« فرآیندی که بعدا مورد
استفاده قرارگرفت ” که بعنوان توالی 16S
شناخته می¬شود” تصویری بسیار دقیق از
ترکیب باکتری¬های دست نخورده به ما نشان
می¬دهد.»
تجزیه و تحلیل سواب¬های پوستی واقعی نیز به همان اندازه
موفقیت¬آمیز بود و هیچ DNA از باکتری¬های مرده در نمونه یافت نشد.
دکتر Koberle اطمینان دارد که این رویکرد نقشی کلیدی در تحقیقات آینده
ایفا خواهدکرد.
او میگوید:« انتخاب باکتری¬های زنده
پوست به کمک آنزیم¬ها می¬تواند به ما
کمک¬کند تا نشانگرهای زیستی میکروبی را
برای بیماری¬های پوستی خاص پیداکنیم و
همچنن آن دسته از باکتری¬هایی که بر روند
بیماری تاثیر مثبت دارند شناسایی کنیم.»
این روش جدید، برای تجزیه و تحلیل میکروبیوم درحال حاضر در بسیاری
از مطالعات گروهی در مورد بیماری¬های پوستی در کلینیک TUM و
درماتولوژی مورد استفاده قرارمی¬گیرد.
به امید روزی که بتوانیم از این روش جدید برای درمان بیماری¬های آزار
دهنده پوستی استفاده کنیم.
ترجمه و بازنویسی: نگار رحمتی
گردآورنده: مریم جلالی
رفرنس :
https://www.sciencedaily.com/releases/2021/08/210810130803.htm
https://www.sciencedaily.com/releases/2021/08/210810130803.htm
